AI 기반 계산 약물 발견을 위한 필수 자원

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데이터 과학/AI

인공지능, 머신러닝

AI와 생물정보학의 통합을 통해 계산 약물 발견이 가능해졌으며, AlphaFold, Atomwise, Exscientia 등 플랫폼의 활용이 핵심
ChEMBL, DrugBank, BindingDB 등의 데이터베이스는 약물-타겟 상호작용 분석에 필수적
RDKit, Avogadro, Open Babel 같은 오픈소스 화학정보학 도구는 분자 설계 및 분석의 기반이 됨

Atomwise: AtomNet AI 엔진으로 소분자-단백질 결합 예측, 실제 약물 개발 사례 제공
Exscientia: Generative AI를 활용한 정밀 약물 설계, Recursion과 협업 확대
AIDDISSON: Generative AI 및 머신러닝으로 화학공간 탐색, 제조 가능성 분석
AlphaFold: Protein Structure Prediction의 정확도 혁신, EMBL-EBI에서 공개된 3D 단백질 구조 데이터베이스
AMPLIFY: Protein Language Model (pLM)로 단백질 설계 도구 접근성 향상
Polaris: AI 약물 발견 모델 평가를 위한 벤치마킹 플랫폼, 주요 제약사 협력

ChEMBL: Drug-like properties를 가진 생물활성 분자 데이터, Drug-Target Interactions 분석
DrugBank: 약물 분자 기전, 타겟, 상호작용 정보 제공, Drug Repositioning 연구에 유용
Open Targets: 유전체, 유전체 데이터와 질병-약물 타겟 연계, Target Validation 지원
BindingDB: Experimentally Measured Binding Affinities 데이터, Virtual Screening 및 Ligand Design에 활용
DGIdb: Druggable Genes 및 약물-유전자 상호작용 정보 제공, Novel Drug Target Identification 지원
TTD (Therapeutic Target Database): Target-Centric Drug Discovery 지원, 질병-경로-약물 정보 통합

Click2Drug: CADD (Computer-Aided Drug Design) 소프트웨어, 데이터베이스, 웹서비스 종합 디렉토리
Avogadro: Molecular Modeling 및 Bioinformatics에 사용되는 무료 분자 편집기
PyRx: Virtual Screening 소프트웨어, 화합물 라이브러리 탐색 최적화
RDKit: Open-Source Cheminformatics Library, 분자 표현, 지문 생성, 하위구조 탐색 기능
Open Babel: Chemical File Format Interconversion 지원, Cheminformatics Workflows 데이터 준비에 필수
CDK (Chemistry Development Kit): Computational Chemistry 및 Bioinformatics 도구, 약물 설계 파이프라인 구축
OpenChem: Deep Learning Toolkit (PyTorch 기반), Computational Chemistry 및 Drug Design 모델 개발

AlphaFold를 활용한 3D 단백질 구조 예측과 RDKit의 분자 지문 생성 기능은 약물 발견의 핵심 단계를 가속화
ChEMBL, DrugBank와 같은 데이터베이스는 Drug-Target Interaction 분석을 위한 필수 자원
Open Source Tools (예: Avogadro, Open Babel)의 활용은 Computational Drug Discovery 접근성을 높임