중앙도그마 탐색기 프로젝트 요약

카테고리

프로그래밍/소프트웨어 개발

서브카테고리

바이브코딩

대상자

• 생물정보학 개발자, AI 교육 도구 개발자, 생명과학 교육자
• 중급 이상의 Python 프로그래밍 경험과 생물학 기초 지식이 필요

핵심 요약

• Biopython을 활용한 유전자 시퀀스 처리 및 LLM 기반 생물학적 과정 설명 기능 구현
• Streamlit을 통한 사용자 인터페이스 개발로 DNA→mRNA→아미노산 전 과정 시각화
• fetch_gene_sequence() 및 transcribe_translate_dna() 함수를 통해 생물학적 핵심 개념(전사, 번역)을 코드화

섹션별 세부 요약

1. Biopython 통합 구현

• fetch_gene_sequence(gene_symbol, organism="Homo sapiens") 함수로 유전자 시퀀스 검색
• transcribe_translate_dna(dna_seq) 함수로 DNA→mRNA→아미노산 시퀀스 변환
• 유전자 데이터 처리 및 생물학적 과정의 기초적인 알고리즘 구현

2. LLM 기반 생물학 설명 기능

• generate_explanation(dna_seq) 함수로 AI가 생물학적 과정을 초보자용으로 설명
• PromptTemplate을 통해 LLM에게 명확한 입력 변수(sequence) 정의
• 500bp 이하의 DNA 시퀀스에 대한 설명 제한으로 성능 최적화

3. Streamlit 사용자 인터페이스

• DNA 시퀀스, mRNA 전사체, 아미노산 시퀀스의 시각적 표시
• st.code() 및 st.markdown()을 활용한 코드 및 텍스트 출력
• 사용자 친화적인 UI 설계로 교육적, 상호작용적 기능 구현

결론

• Biopython + AI + Streamlit의 조합으로 생물학적 개념을 교육 도구로 구현한 사례
• fetch_gene_sequence()와 transcribe_translate_dna() 함수를 핵심으로 활용
• 프로젝트 튜토리얼 동영상(https://youtu.be/2qi5UPiiS1Q)을 통해 구현 방법 공유 및 피드백 요청